Nie ma możliwości indywidualnego dofinansowania studiów doktoranckich z Funduszy Europejskich, ponieważ to uczelnie mogą składać projekty na wsparcie tworzonych przez nie kierunków.
Bazę kierunków współfinansowanych z Funduszy Europejskich w ramach projektów uczelni można odnaleźć na stronie internetowej www.inwestycjawkadry.pl 
Istnieje również możliwość otrzymania grantu na realizację projektu badawczego, stanowiącego podstawę do napisania pracy doktoranckiej. Odbywa się to w ramach Programu Innowacyjna Gospodarka w Działaniu 1.2 Wzmocnienie potencjału kadrowego nauki.
W jego ramach realizowane są następujące programy:
-
Program TEAM - wsparcie projektów z udziałem studentów, doktorantów i uczestników staży podoktorskich realizowanych w najlepszych zespołach badawczych w Polsce
-
Program Międzynarodowe Projekty Doktoranckie (MPD) - wsparcie jednostek współpracujących z partnerem zagranicznym przy realizacji studiów doktoranckich
-
Program VENTURES - wsparcie projektów aplikacyjnych mających zastosowanie w gospodarce, realizowanych przez studentów, absolwentów i doktorantów
-
Program WELCOME - wsparcie projektów realizowanych przez wybitnych uczonych z zagranicy tworzących zespoły badawcze w polskich jednostkach naukowych
-
Program POMOST- granty dla rodziców ułatwiające powrót do pracy naukowej oraz wspierające kobiety w ciąży pracujące naukowo
-
Program HOMING PLUS - subsydia dla młodych uczonych zachęcające do podjęcia pracy badawczej w Polsce
Realizacją Działania 1.2. zajmuje się:
Fundacja na rzecz Nauki Polskiej
ul. Grażyny 11
02-548 Warszawa
tel.: 22 845 95 00
faks 22 845 95 05
e-mail: fnp@fnp.org.pl
www.fnp.org.pl 
W ramach Programu Kapitał Ludzki, Poddziałania 8.2.2 Regionalne Strategie Innowacji, możliwe będzie ubieganie się o stypendia naukowe dla doktorantów, kształcących się na kierunkach uznanych za szczególnie istotne z punktu widzenia rozwoju województwa (określonych w Regionalnej Strategii Innowacji danego województwa). Poddziałaniem 8.2.2 zajmują się poszczególne Urzędy Marszałkowskie w poszczególnych województwach.
Program Kapitał Ludzki w Poddziałaniu 4.1.1 Wzmocnienie potencjału dydaktycznego uczelni, przewiduje możliwość wsparcia finansowego przeznaczonego m.in. na:
-
stypendia dla doktorantów, młodych doktorów (postdoców) i profesorów wizytujących zatrudnionych w instytucjach szkolnictwa wyższego w dziedzinach szczególnie istotnych dla rozwoju gospodarki;
-
przygotowanie, otwieranie i realizację nowych kierunków studiów, studiów podyplomowych, studiów doktoranckich (w tym interdyscyplinarnych studiów doktoranckich);
-
organizowanie staży i szkoleń w wiodących zagranicznych i krajowych ośrodkach akademickich i naukowo–badawczych dla kadry dydaktycznej uczelni przydatnych dla prowadzenia pracy dydaktycznej (w tym staże dla doktorantów i staże postdoktorskie);
-
podnoszenie kompetencji dydaktycznych kadry akademickiej w celu podwyższania jakości nauczania.
Informacje o Poddziałaniu 4.1.1, w tym listy dofinansowanych kierunków, można uzyskać w Departamencie Wdrożeń i Innowacji Ministerstwa Nauki i Szkolnictwa Wyższego (tel.: 22 628 32 29, 529 26 03 i na stronie www.nauka.gov.pl
).